Возмещение средств из ФСС в случае, если работница перед декретом работала в другом городе

Всем, добрый день!
Устроилась работать в новую фирму недавно, буквально месяц назад, разбирала бумаги после предыдущего бухгалтера.
В компании есть декретницы, одна из них работала в одном месте а по беременности наблюдалась в другом (два разных города, территориально расположенных не близко, почти 200 км), дело в том, что как мне пояснил директор, девушка узнала о своей беременности, встала на учет по месту жительства, но потом по семейным обстоятельствам была вынуждена уехать в другой город, а так как у данной компании там есть для нее рабочее место, торговая точка, то она там и стала работать. Но наблюдаться продолжала в своей ЖК по месту прописки, приезжая к матери раз в месяц. Соответственно когда подошел срок выхода в декрет, ей ЖК выдали больничный лист, причем последний месяц перед выходом в декрет, она уже работала в своем городе. 
Но у меня от всей этой ситуации есть сомнения, как на все это посмотрит ФСС, ведь во всех документах она числится в городе по месту работы, она туда она и была принята изначально, но место прописки у нее другое, и она там состояла на учете в ЖК. Не будет ли потом проблем с возмещением ФСС по ней? и еще прочитала что возмещения в 2017 году будут происходить через ФНС, будет ли ФНС передавать в ФСС данные о том, в какую инспекцию был оплачен НДФЛ?
С уважением.